Completed projets (in French only)

BDG

H2020 BigDataGrapes (contrat 780751) : Big Data to Enable Global Disruption of the Grapevine-powered Industries (2018-2020)

  • Responsable local : Pascal Neveu
  • https://www.bigdatagrapes.eu
  • Le rôle de MISTEA était d'une part de participer aux développements méthodologiques concernant la structuration, l'analyse et la valorisation du Big data de la filère viti-vinicole et d'autre part d'assurer les liens vers les sources données et les acteurs de la filière.
Aginfra

H2020 AGINFRA PLUS (contrat 731001) : Accelerating user-driven e-infrastructure innovation in Food Agriculture (2017-2019)

  • Responsable local : Pascal Neveu
  • https://plus.aginfra.eu
  • L'UMR MISTEA était en charge du Work Package Food Security avec comme objectifs de formaliser les besoins des communautés "Plant Sciences", de prendre part à la conception et au développement de services orientés données et enfin de valider ces services auprès de groupes représentatifs des communautés scientifiques autour de la sécurité alimentaire.
agreenskills

CAS - Agreenskills EU Program : Modelling and simulation of the toxic blooms dynamics of cyanobacterial population of the Lake Taihu (2014-2015)

FP7

EU FP7 CAFE (contrat 212754) : Computer-aided food processes for control engineering (2008-2013)

  • Responsable local : Pascal Neveu
  • https://cordis.europa.eu/project/id/212754/results
  • Le rôle de MISTEA dans CAFE est de concevoir des stratégies de commande en temps réel adaptées à des systèmes dont les entrées sont contraintes les unes par rapport aux autres. L'objet d'application est un fermenteur continu multi-étagé développé par l'UMR SPO qui permet d'étudier les levures impliquées dans la fermentation alcoolique en les stabilisant dans un état physiologique donné.
ANR logo

ANR SoilMicro3D (Projet-ANR-15-CE01-0006) : Propriétés émergentes des fonctions microbiennes dans les sols : Identification de descripteurs spatiaux de la structure du sol à partir de modélisations 3D à l'échelle des habitats microbiens - Soilµ-3D (2015-2020)

  • Responsable local : Alain Rapaport
  • https://www6.inrae.fr/soilmicro3D
  • MISTEA est partenaire de ce projet ANR portant sur la modélisation et la simulation numérique de l'activité microbienne des sols et le rôle de la structure spatiale du sol sur le fonctionnement de écosystème microbien, notamment en termes d'émission de gaz à effet de serre dans un contexte de changement climatique. Ce projet a financé la thèse d'Alexandre Coche co encadrée par Jean-Raynald de Dreuzy (Géosciences Rennes) et Alain Rapaport (MISTEA).
ANR logo

ANR DISCO (contrat ANR-AAP215-SYSCOMM-2009) : Modélisation multi-échelles du COuplage bioDiversité Structure dans les biofilms (2009-2013)

  • Responsable local : Alain Rapaport
  • https://sites.google.com/site/anrdisco/reports
  • MISTEA est le coordinateur de ce projet, dont l'objectif est de développer et d'étudier des modèles computationnels et mathématiques de la dynamique des biofilms, par une approche de modélisation multi-échelle, prenant en compte la biodiversité (distribution des espèces de bactéries) et la structure spatiale. DISCO a financé le postdoc de Chloé Deygout.
ANR logo

ANR DIMINOS : Lien  entre  la  diversité  microbienne  et  le  turn-over des matières organiques dans les sols agricoles (2008-2013)

  • Responsable local : Alain Rapaport
  • https://anr.fr/Projet-ANR-08-STRA-0006
  • MISTEA est partenaire ce projet dont l’objectif principal est de progresser dans la compréhension de l’écologie fonctionnelle des acteurs microbiens impliqués dans la dégradation des matières organiques du sol et permettre la mise au point d’outils d’aide à la décision pour définir des pratiques agricoles permettant de "produire mieux et polluer moins".
FEDER
oseo

FEDER - OSEO PILOTYPE : Outils d'aide à la décision pour améliorer la compétitivité des vins à l'export (2011-2014)

Digitag

PIA ANR #DigitAg / projet OPTI-REUSE : A digital Platform for the optimisation of water and nutrient ressources in agriculture, including treated waste water reuse (2018-2019)

Logo PHC Tournesol

Hubert Curien PHC Belgique TOURNESOL : Apport de la modélisation pour la compréhension du fonctionnement des écosystèmes microbiens (2016-2018)

  • Responsable local : Alain Rapaport
  • MISTEA est coordinateur de ce projet France-Belgique portant sur la modélisation de bioprocédés, plus spécifiquement sur les mécanismes à l’origine des sur-rendements observés en fermentation, et à la reconstruction en temps réel des concentrations à partir de mesure de biogaz en batch.

Département EA

INRA

 INRA Dép-EA / projet SENSICLIM : Approches innovantes pour analyser l’impact du climat et de ses composantes sur les modèles environnementaux (2017-2019)

  • Responsable local : Sébastien Roux
  • Le rôle de MISTEA dans SENSICLIM est de développer des méthodes d'analyse de sensibilité de modèles agronomiques en se focalisant sur les entrées climatiques de ces modèles. 
ANR logo

ANR GIGASSAT (contrat ANR-12-AGRO-0001-09) : Adaptation des écosystèmes ostréicoles au changement global (2012-2016)

  • Responsable local: Patrice Loisel
  • http://www.gigassat.org
  • L'UMR MISTEA est responsable de la construction d'un modèle bioéconomique.
Fruition Sciences

Fruition Sciences IDENOV : Intégration d'expertise et de données pour une nouvelle génération d'outils en viticulture (2014-2015)

  • Responsable local : Nadine Hilgert
STIC

Programme Stic-Amsud MOSTICAW (contrat numcontrat+lien) : Modeling the Spread and (opTimal) Control of Arboviroses (2016-2017)

  • Responsable local : Alain Rapaport
  • MISTEA est un participant de ce projet internatuonal France-Amérique du Sud (MOdeling the Spread and (opTImal) Control of Arboviroses by Wolbachia) qui concerne une nouvelle méthode de contrôle de la dengue, et potentiellement d'autres maladies graves transmises par les moustiques Aedes (chikungunya, fièvre jaune). L'objectif du projet est d'élaborer et d'analyser des modèles connexes, ainsi que des stratégies de contrôle, dans le but de tester les concepts et d'estimer la faisabilité.

DYMECOS: DYnamical Microbial and Environmental eCOSystems (2009-2015)

  • Responsable local : Alain Rapaport
  • https://sites.google.com/site/eadymecos
  • MISTEA est le coordinateur de cette équipe associée INRIA avec le Chili, dont le programme scientifique porte sur les représentations parcimonieuses de l'hétérogénéité spatiale en milieu liquide pour les bioprocédés naturels et industriels et le contrôle optimal pour le pilotage des bioprocédés.
Métaprogramme ACCAF

INRA Métaprogramme ACCAF / projet LACCAVE : Impacts et adaptation de la filière Vigne et Vin au Changement climatique (2012-2016)

  • Responsable local : Pascal Neveu
  • https://www6.inrae.fr/laccave/Projet
  • Financé par le méta-programme INRA ACCAF, l'objectif est l'étude des différentes solutions pour adapter au plus vite le vignoble français au changement climatique. Ce projet regroupe des partenaires de différentes disciplines (physiciens, généticiens, écophysiologistes, microbiologistes…) travaillant à différentes échelles. Notre rôle est de proposer des méthodes et outils pour traiter des ensembles de données à ces échelles.
Métaprogramme ACCAF

INRA Métaprogramme ACCAF / projet APICC (APICC) : Adaptation of Pluri-Specific Systems to Climate Change (2012-2016)

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PIA ANR - Labex NUMEV / Contrat doctoral : Optimisation et prédiction de la production algale en polycultures: approches expérimentales et modélisation mathématique (2016-2019)

  • Responsable local : Alain Rapaport
  • MISTEA a obtenu le co-financement de la la thèse d'Emna Krichen par le Labex Numev et l'ADEME, qui porte sur l'optimisation et la prédiction de la production algale en polycultures à l'aide d'approches expérimentales et la modélisation mathématique. La thèse est  co-dirigée par Alain Rapaport (UMR MISTEA) et Eric Fouilland (UMR MARBEC).
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PIA ANR - Labex NUMEV / Contrat Postdoctoral : Modélisation, simulation et optimisation de la recharge de lacs à l’aide d’eaux traitées (2017-2018)

  • Responsable local : Alain Rapaport
  • L'UMR MISTEA et l'équipe-projet INRIA LEMON ont obtenu le financement du postdoc de Maria Crespo qui porte sur la modélisation, la simulation et l'optimisation de l'hydrodynamique de grands réservoirs hydriques (lacs, lagunes) en vue de sa recharge (cas du lac de Jaunay). Le projet est mené en collaboration avec Vendée Eau et la SAUR.
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PIA ANR - Agropolis Fondation Labex AGRO : Methods ands tools for decision support relating to sustainable management of babassu palm tree in pastures (2014-2017)

  • Responsable local : Patrice Loisel
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ANR FOR-WIND : Adaptation sylvicole et économique de l’aménagement forestier au risque vent (2012-2017)

Département CEPIA

INRA

INRA Dép-CEPIA : New perspectives for the Multi-Stage Continuous Fermentor (2013-2014)

Agropolis-Fondation_inra_image

PIA ANR - Agropolis Fondation Labex AGRO / Projet ECOW : Ecological therories and Control methods for the Optimization of Wes-african AGroecosystems (2018-2019)

  • Responsable local : Céline Casenave
  • Le rôle de MISTEA dans ECOW est de proposer des stratégies de gestion adaptative des systèmes agro-sylvo-pastoraux d'Afrique de l'Ouest en utilisant des outils de la théorie de la commande. Ce projet a financé une partie de la thèse de Anne Bisson.
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INRA

ARC INRIA VITELBIO : VIrtual TELuric BIOreactors (2008-2010)

  • Responsable local : Alain Rapaport
  • https://sites.google.com/site/vitelbio/Home
  • VITELBIO est une action de recherche collaborative soutenue par INRIA et coordonnée par MISTEA, qui propose de définir et développer un modèle numérique de représentation spatiale des transferts réactifs du sol, sous forme de "bioréacteur virtuel à compartiments". 
    Un logiciel est développé conjointement avec la société ITK.
GIP ECOFOR

GIP ECOFOR ECO-RISQUES : Optimisation et viabilité de la gestion forestière en présence de risques (2013-2015)

Metaprogramme MEM

INRA Métaprogramme MEM / projet E-noc : Reverse-modeling of metagenome data for microbial resource management (2012-2013)

  • Responsable local : Nadine Hilgert
  • https://sites.google.com/site/enocprojetreversemodelling/
  • Financé par le méta-programme MEM (Méta-génomique des Ecosystèmes Microbiens) de l’INRA, ce projet développe une approche multidisciplinaire partagée par des microbiologistes et mathématiciens pour une « ingénierie inverse » des données méta-génomiques pour la gestion de ressources microbiennes.
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PIA ANR - Agropolis Fondation Labex AGRO / Projet Biolnh : Modélisation et optimisation de la bioconversion de matière première végétale en milieu inhomogène (2009-2010)

  • Responsable local : Alain Rapaport
  • MISTEA est co-leader avec l'UMR IATE du projet "BioInh" dans le cadre du programme "Computational Plants and Eco-Systems" lancé par la Fondation Agropolis, dont l'objectif est la modélisation mathématique et l'optimisation de la bioconversion de matières végétales en milieu inhomogène. Ce projet a financé le postdoc d'Alem Saddoud.
ANR logo

ANR ECOMIC-RMQS : Microbio-géographie à l'échelle de la France par application d'outils moléculaires au réseau français de mesures de la qualité des sols (2006-2009)

  • Responsable local : Alain Rapaport
  • https://anr.fr/Projet-ANR-06-BDIV-0011
  • MISTEA est partenaire de l'ANR ECOMIC-RMQS qui a pour objectif de mieux définir et comprendre les processus qui génèrent et maintiennent la biodiversité microbienne des sols, et évaluer les impacts environnementaux, en utilisant des outils  de la biologie moléculaire, les statistiques et la modélisation. La thèse de Miled El Hajji a été partiellement financée par ce projet.

INRIA - CONICYT ECOLOMICRO: Dynamical Modeling of Microbial Ecosystems (2006-2007) et Modeling, control and optimization of bio-processes involved in waste-water treatment (2008-2009) 

  • Responsable local : Alain Rapaport
  • ECOLOMICRO est un projet international INRIA-Conycit lancé conjointement par MISTEA et CMM (Centro de Modelamiento Matematico, UMR CNRS Santiago du Chili) qui traite de l'estimation d'entrées inconnues dans les modèles de biorécateurs et du contrôle impulsif optimal pour les réacteurs fed-batch pour la bioremédiation d'eaux contaminées.
INRA
CEMAGREF

Action structurante INRA - Cemagref AQUAE : Durabilité et gestion quantitative de la ressource en eau : Commande de systèmes à retard (1999-2002)

  • Responsable local: Alain Rapaport
  • Dans le cadre de l'action structurante INRA-Cemagref "AQUAE", les unités MISTEA et G-EAU on proposé un projet de recherche méthodologique portant sur la durabilité dans le gestion de ressources hydriques présentant des retards importants entre l'exploitation et la recharge. Un logiciel libre a été développé dans ce cadre.
ADEME

Coopération bilatérale France - UK : Programme alliance 1998 (1998-2000)

  • Responsable local: Alain Rapaport
  • Il s'agit d'un projet de coopération bilatérale entre MISTEA et l'Imperial College (Londres) portant sur la commande robuste de bioréacteurs de dépollution.